Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID4AP29374 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms