Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB2P29033 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB2P29033 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB2P29033 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB2P29033 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB2P29033 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB2P29033 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB2P29033 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB2P29033 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB2P29033 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB2P29033 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB2P29033 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB2P29033 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB2P29033 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB2P29033 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB2P29033 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB2P29033 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB2P29033 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB2P29033 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB2P29033 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB2P29033 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB2P29033 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB2P29033 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB2P29033 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB2P29033 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms