Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP1P28562 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms