Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBRP28336 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBRP28336 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBRP28336 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBRP28336 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBRP28336 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBRP28336 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NMBRP28336 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMBRP28336 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMBRP28336 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMBRP28336 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NMBRP28336 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMBRP28336 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMBRP28336 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMBRP28336 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBRP28336 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBRP28336 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms