Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX2P28328 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX2P28328 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX2P28328 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX2P28328 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX2P28328 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX2P28328 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX2P28328 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX2P28328 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX2P28328 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX2P28328 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX2P28328 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX2P28328 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX2P28328 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX2P28328 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX2P28328 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX2P28328 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX2P28328 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX2P28328 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX2P28328 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX2P28328 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX2P28328 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX2P28328 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX2P28328 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms