Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1BP28222 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HTR1BP28222 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1BP28222 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms