Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B4P23634 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms