Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4BP23588 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms