Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRDP23468 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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