Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB4P21439 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms