Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRHP20396 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRHP20396 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRHP20396 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRHP20396 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRHP20396 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRHP20396 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRHP20396 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRHP20396 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRHP20396 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRHP20396 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
TRHP20396 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRHP20396 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRHP20396 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRHP20396 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRHP20396 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRHP20396 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRHP20396 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRHP20396 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRHP20396 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRHP20396 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRHP20396 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRHP20396 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRHP20396 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TRHP20396 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRHP20396 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRHP20396 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TRHP20396 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRHP20396 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRHP20396 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TRHP20396 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRHP20396 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRHP20396 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRHP20396 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRHP20396 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TRHP20396 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TRHP20396 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRHP20396 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRHP20396 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRHP20396 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRHP20396 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRHP20396 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRHP20396 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRHP20396 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRHP20396 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TRHP20396 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRHP20396 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRHP20396 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRHP20396 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRHP20396 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRHP20396 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRHP20396 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRHP20396 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRHP20396 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRHP20396 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRHP20396 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRHP20396 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRHP20396 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRHP20396 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRHP20396 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRHP20396 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRHP20396 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TRHP20396 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRHP20396 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms