Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDSP20132 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDSP20132 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDSP20132 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDSP20132 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDSP20132 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDSP20132 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDSP20132 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDSP20132 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDSP20132 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDSP20132 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSP20132 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SDSP20132 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDSP20132 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SDSP20132 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SDSP20132 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDSP20132 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDSP20132 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SDSP20132 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDSP20132 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SDSP20132 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDSP20132 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDSP20132 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDSP20132 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDSP20132 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDSP20132 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDSP20132 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms