Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL2P19875 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL2P19875 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL2P19875 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL2P19875 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL2P19875 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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