Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNI1P19237 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms