Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT4P19013 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT4P19013 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT4P19013 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT4P19013 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT4P19013 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT4P19013 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT4P19013 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT4P19013 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT4P19013 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT4P19013 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT4P19013 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT4P19013 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT4P19013 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT4P19013 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT4P19013 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT4P19013 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT4P19013 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT4P19013 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT4P19013 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT4P19013 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT4P19013 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT4P19013 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT4P19013 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT4P19013 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT4P19013 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms