Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT15P19012 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT15P19012 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT15P19012 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT15P19012 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT15P19012 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT15P19012 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT15P19012 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT15P19012 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms