Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRAP18433 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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