Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPCAMP16422 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPCAMP16422 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPCAMP16422 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPCAMP16422 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPCAMP16422 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPCAMP16422 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPCAMP16422 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms