Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFXP16104 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFXP16104 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms