Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD44P16070 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD44P16070 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD44P16070 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD44P16070 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD44P16070 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD44P16070 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD44P16070 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD44P16070 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD44P16070 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD44P16070 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD44P16070 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD44P16070 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD44P16070 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD44P16070 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD44P16070 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD44P16070 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms