Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF3P15923 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF3P15923 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF3P15923 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF3P15923 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF3P15923 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF3P15923 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF3P15923 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF3P15923 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF3P15923 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF3P15923 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF3P15923 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF3P15923 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF3P15923 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF3P15923 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF3P15923 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF3P15923 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF3P15923 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF3P15923 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms