Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD46P15529 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD46P15529 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD46P15529 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CD46P15529 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD46P15529 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD46P15529 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD46P15529 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD46P15529 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD46P15529 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD46P15529 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD46P15529 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD46P15529 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD46P15529 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD46P15529 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD46P15529 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD46P15529 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD46P15529 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD46P15529 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD46P15529 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms