Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA1P14867 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms