Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC5A1P13866 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC5A1P13866 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms