Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms