Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL6A2P12110 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms