Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
TOP2AP11388 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TOP2AP11388 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms