Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CHGAP10645 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHGAP10645 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHGAP10645 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHGAP10645 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHGAP10645 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CHGAP10645 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHGAP10645 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHGAP10645 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHGAP10645 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHGAP10645 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHGAP10645 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHGAP10645 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHGAP10645 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHGAP10645 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHGAP10645 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHGAP10645 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHGAP10645 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHGAP10645 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHGAP10645 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHGAP10645 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHGAP10645 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHGAP10645 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHGAP10645 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHGAP10645 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHGAP10645 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHGAP10645 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CHGAP10645 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHGAP10645 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHGAP10645 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHGAP10645 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHGAP10645 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHGAP10645 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHGAP10645 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHGAP10645 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHGAP10645 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHGAP10645 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHGAP10645 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHGAP10645 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHGAP10645 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHGAP10645 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHGAP10645 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHGAP10645 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHGAP10645 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHGAP10645 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CHGAP10645 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHGAP10645 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CHGAP10645 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHGAP10645 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHGAP10645 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHGAP10645 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHGAP10645 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHGAP10645 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHGAP10645 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHGAP10645 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHGAP10645 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHGAP10645 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHGAP10645 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHGAP10645 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHGAP10645 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHGAP10645 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHGAP10645 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CHGAP10645 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHGAP10645 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHGAP10645 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHGAP10645 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms