Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HKR1P10072 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HKR1P10072 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HKR1P10072 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HKR1P10072 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HKR1P10072 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HKR1P10072 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HKR1P10072 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HKR1P10072 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HKR1P10072 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HKR1P10072 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HKR1P10072 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HKR1P10072 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HKR1P10072 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HKR1P10072 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HKR1P10072 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HKR1P10072 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms