Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2BP0DI82 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms