Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP1P09874 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP1P09874 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP1P09874 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PARP1P09874 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP1P09874 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP1P09874 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP1P09874 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP1P09874 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP1P09874 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP1P09874 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP1P09874 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP1P09874 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP1P09874 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP1P09874 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP1P09874 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP1P09874 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP1P09874 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP1P09874 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP1P09874 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP1P09874 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP1P09874 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP1P09874 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP1P09874 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP1P09874 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP1P09874 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP1P09874 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP1P09874 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP1P09874 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP1P09874 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP1P09874 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP1P09874 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP1P09874 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP1P09874 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP1P09874 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP1P09874 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP1P09874 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms