Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AB1P08238 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms