Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTMAP06454 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTMAP06454 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTMAP06454 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTMAP06454 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTMAP06454 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTMAP06454 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTMAP06454 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTMAP06454 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTMAP06454 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTMAP06454 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTMAP06454 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTMAP06454 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTMAP06454 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTMAP06454 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTMAP06454 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTMAP06454 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTMAP06454 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTMAP06454 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTMAP06454 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTMAP06454 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTMAP06454 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms