Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms