Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAK4O96013 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAK4O96013 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PAK4O96013 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAK4O96013 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAK4O96013 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK4O96013 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK4O96013 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK4O96013 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK4O96013 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK4O96013 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK4O96013 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK4O96013 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAK4O96013 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK4O96013 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAK4O96013 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK4O96013 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK4O96013 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PAK4O96013 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK4O96013 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PAK4O96013 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK4O96013 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK4O96013 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK4O96013 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK4O96013 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK4O96013 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK4O96013 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK4O96013 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK4O96013 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK4O96013 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK4O96013 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK4O96013 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK4O96013 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK4O96013 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK4O96013 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK4O96013 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK4O96013 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAK4O96013 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAK4O96013 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PAK4O96013 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAK4O96013 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAK4O96013 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms