Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms