Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFASCO94856 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFASCO94856 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFASCO94856 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFASCO94856 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFASCO94856 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFASCO94856 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFASCO94856 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFASCO94856 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFASCO94856 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFASCO94856 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFASCO94856 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFASCO94856 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFASCO94856 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFASCO94856 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NFASCO94856 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFASCO94856 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFASCO94856 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFASCO94856 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFASCO94856 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFASCO94856 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFASCO94856 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFASCO94856 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFASCO94856 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFASCO94856 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFASCO94856 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFASCO94856 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFASCO94856 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFASCO94856 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFASCO94856 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFASCO94856 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFASCO94856 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFASCO94856 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFASCO94856 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms