Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALDH1A2O94788 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms