Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN5O75503 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN5O75503 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN5O75503 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLN5O75503 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN5O75503 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms