Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC4O75487 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC4O75487 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC4O75487 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC4O75487 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC4O75487 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC4O75487 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC4O75487 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC4O75487 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC4O75487 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC4O75487 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC4O75487 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC4O75487 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC4O75487 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC4O75487 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC4O75487 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC4O75487 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC4O75487 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC4O75487 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC4O75487 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC4O75487 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC4O75487 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC4O75487 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC4O75487 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC4O75487 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC4O75487 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPC4O75487 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC4O75487 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC4O75487 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC4O75487 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC4O75487 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms