Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMPCBO75439 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMPCBO75439 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms