Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP3O75386 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP3O75386 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP3O75386 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP3O75386 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP3O75386 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP3O75386 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP3O75386 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP3O75386 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP3O75386 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP3O75386 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP3O75386 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP3O75386 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP3O75386 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP3O75386 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP3O75386 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP3O75386 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP3O75386 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP3O75386 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms