Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX3O75364 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX3O75364 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX3O75364 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX3O75364 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PITX3O75364 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX3O75364 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms