Protein–RNA interactions for Protein: O75360

PROP1, Homeobox protein prophet of Pit-1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROP1O75360 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROP1O75360 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROP1O75360 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROP1O75360 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROP1O75360 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PROP1O75360 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PROP1O75360 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROP1O75360 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROP1O75360 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROP1O75360 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROP1O75360 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROP1O75360 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PROP1O75360 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROP1O75360 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PROP1O75360 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PROP1O75360 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PROP1O75360 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PROP1O75360 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PROP1O75360 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PROP1O75360 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PROP1O75360 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms