Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms