Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRGAP2O75044 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms