Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBNO60934 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBNO60934 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBNO60934 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBNO60934 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NBNO60934 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBNO60934 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBNO60934 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBNO60934 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBNO60934 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBNO60934 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBNO60934 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBNO60934 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NBNO60934 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBNO60934 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBNO60934 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBNO60934 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBNO60934 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBNO60934 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBNO60934 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBNO60934 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBNO60934 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBNO60934 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBNO60934 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBNO60934 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBNO60934 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBNO60934 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBNO60934 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBNO60934 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBNO60934 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBNO60934 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBNO60934 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBNO60934 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms