Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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