Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPAA1O43292 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
GPAA1O43292 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms