Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC5O15511 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms